La RBCS por su importancia tanto ambiental como social, tiene entre sus objetivos:
Mantener y preservar la biodiversidad de dos ecosistemas, el altiplano y los valles intermedios; además es reserva de una notable variedad de recursos genéticos especialmente en relación con productos agrícolas tradicionales (tubérculos, maíz).
La cordillera donde se establece la reserva, juega un papel importante en la provisión de agua potable a la ciudad de Tarija (capital del departamento, en torno a la cual gira la actividad económica y política de la región) y para riego a las poblaciones rurales, además de generación de energía eléctrica. La reserva conserva una particular belleza escénica debido al marcado gradiente y a la presencia de lagunas altoandinas, también existen sitios de valor arqueológico (ruinas de origen incaico y pinturas rupestres) que son de importancia para entender el pasado de la región. El Estudio de Actualización del Plan de Manejo de la Reserva Biológica Cordillera de Sama 2017 – 2026, dio como resultados importantes insumos para la gestión del área protegida, entre ellas, se indica que la Reserva Biológica Cordillera de Sama se encuentra en un buen estado de conservación desde el punto de vista de la funcionalidad de sus sistemas de vida, que tienen como núcleo las cuencas y micro cuencas que proveen de agua a las poblaciones del Valle Central de Tarija, teniendo como principal beneficiario a la ciudad de Tarija, poblaciones aledañas y al altiplano tarijeño. De igual manera, las nacientes del río Tolomosa que alimentan el embalse de San Jacinto, fuente de agua y energía para el sector productivo agrícola y pecuario del Valle Central de Tarija, están protegidas por la Reserva de Sama. Por otro lado, existe potencialidad para generar ingresos por la actividad turística que beneficien a las comunidades locales de la RBCS y para apoyar las actividades de patrullaje y control que realizan los guardaparques de la RBCS. Actualmente, existen circuitos turísticos en funcionamiento, que aprovechan las características paisajísticas de la Reserva, especialmente de las lagunas de Tajzara debido a que albergan aves acuáticas migratorias emblemáticas como los flamencos andinos y al mismo tiempo, muestran la riqueza arqueológica de la Reserva, teniendo como un eje central los caminos pre-colombinos que atraviesan la Reserva.
